藏族外周血淋巴细胞表达序列标签分析

摘要：

目的 对藏族外周血淋巴细胞cDNA文库进行随机大规模表达序列标签(ESTs)测序并进行生物信息学分析,通过序列比对找到与低氧适应相关基因有关的单核苷酸多态性(SNPs)位点.方法 将部分文库经大肠杆菌BM 25.8质粒化,用5′端测序引物进行测序,利用BLAST程序对获得的ESTs从核苷酸和氨基酸水平进行同源性搜索和比对.结果 经序列比对发现突变位点较多发生在UTR区域,同时一些基因的编码区域也发生蛋白序列的变化.对这些基因注释后发现,有些突变发生在与能量代谢、线粒体相关的基因及一氧化氮合酶上,如GTPase、NDUFA6、ATP5L、NOSIP.结论 ESTs技术是一个快速、有效寻找新基因的方法,是系统研究不同人群基因表达模式的有力工具.

关键词：藏族、淋巴细胞、表达序列标签、单核苷酸多态性

所属期刊栏目：50

分类号：Q987(人类学)

资助基金：国家自然科学基金资助项目30260034

在线出版日期：2011-01-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：50-52