肠道病毒71型VP1外壳蛋白二级结构及B细胞表位预测

摘要：

目的 预测肠道病毒71型(EV71)外壳蛋白VP1二级结构和B细胞表位,为制备EV71疫苗的研究提供理论基础.方法 应用GOR4、HNN、SOPMA、nnPredict等方法预测EV71 VP1二级结构,并结合亲水性、柔韧性、表面可能性和吴氏抗原指数法综合预测潜在的B细胞表位. 结果 EV71 VP1二级结构以无规卷曲和β-片层为主,含有少量的α-螺旋,少见β-转角; EV71 VP1潜在的B细胞表位很可能位于第67～71位氨基酸残基.结论 联合多种生物信息学方法成功预测了EV71 VP1二级结构和B细胞表位;此为制备EV71疫苗的研究提供了理论基础.

关键词：手足口病、肠道病毒VP1、二级结构、B细胞表位

所属期刊栏目：49

分类号：R373.2(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：河南省教育厅自然科学研究计划项目2008C310007

在线出版日期：2009-12-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：10-12