基于数据库构建乳腺癌焦亡相关基因的预后风险模型

摘要：

目的 探究焦亡相关差异表达基因(DEGs)在乳腺癌中预后价值并构建预后风险模型.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)和肿瘤基因表达数据库(GEO)官网下载乳腺癌的基因测序、临床数据,筛选焦亡相关DEGs.将乳腺癌患者进行聚类分析.在TCGA队列中以最小绝对收缩和选择算子(LASSO)方法建立模型.利用Kaplan-Meier生存曲线、受试者工作特征曲线(ROC)、单因素及多因素Cox回归独立预后因素分析等评价该模型.GEO队列为验证集.通过GO、KEGG、ssGSEA分析风险DEGs的富集情况.结果 筛选出焦亡相关DEGs,聚类分析可见C2组总生存期(OS)延长,差异有统计学意义(P=0.020).该模型K-M生存分析显示,高风险组OS缩短(TCGA队列中P<0.001,GEO队列中P=0.018).ROC曲线下面积(AUC)表明该模型具有一定预测能力.单因素、多因素Cox回归分析表明,年龄,M、N分期和风险评分为OS的独立预测因子.GO、KEGG富集与ssGSEA分析证实了风险相关DEGs与免疫炎症因子和通路有关.结论 研究构建了由9个焦亡相关基因组成的乳腺癌预后风险模型,为乳腺癌患者的风险预后评估提供了参考.

关键词：乳腺癌、焦亡、免疫、预后、预测模型

所属期刊栏目：60

分类号：R737.9(肿瘤学)

资助基金：中国乳腺肿瘤青年学者科研项目;徐州市重点研发计划;江苏省研究生科研与实践创新计划项目

在线出版日期：2022-08-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：34-43