PCR为基础的反向线点杂交及16S～23S rDNA间区测序分析5种少见类型奴卡菌

摘要：

探讨5种新出现的奴卡菌种16S～23S rDNA内转录间隔区（internal transcribed spacer,ITS）DNA基因序列的多态性,筛查特异的奴卡菌种逆向线点杂交（reverse line blot,RLB）探针.方法对6例奴卡菌标本进行ITS基因扩增、克隆、测序,设计奴卡菌种特异探针及ITS间区rDNA基因特异的探针,进行以PCR为基础的RLB(PCR/RLB)杂交试验,不同的RLB型进行ITS基因测序分析,以鉴别不同的奴卡菌种及种内分型.结果发现2个Nocardia beijingensis菌株ITS间区有8个基因序列型,4个RLB型；N.thailandica有4个基因序列型及RLB型；N.blacklockiae有5个基因序列型,3个RLB型,其中N-bla RLBⅢ型与所有Nbla-ITS探针杂交没有信号；N.elegans有5个基因序列型,3个RLB型；N.vinacea有5个基因序列型,2个RLB型.结论通过PCR/RLB试验,准确的ITS基因测序认识了新出现的菌种,即N.beijingensis,N.blacklockiae,N.elegans,N.thailandica及N.vinacea.同时建立了可以大量筛查奴卡菌种的PCR/RLB方法,以进行快速临床诊断及流行病学研究.

关键词：奴卡菌、16S ～ 23S rDNA基因内转录间隔区、内转录间隔区基因序列型、逆向线点杂交、内转录区逆向线点杂交型

所属期刊栏目：32

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

在线出版日期：2011-12-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：469-475