朝仓花椒DIR基因家族的鉴定及分析

摘要：

本研究通过NCBI的BLAST比对分析,最终从朝仓花椒转录组数据库筛选出28条朝仓花椒Dirigent(DIR)蛋白家族的编码基因序列.利用MEGA、MEME、DNAMAN等软件对该蛋白家族进行生物信息学分析,结果显示:从朝仓花椒转录组中获得的28个DIR基因,经过鉴定,在进化上分为6个小组,每个小组的基因数量分别为7、5、1、0、5、10.该家族的蛋白等电点均小于7,均偏酸性,且多数属于稳定蛋白.多基因序列比对比发现,该家族蛋白均具有一个高保守性的DIR结构域.空间结构的分析预测ZpDIR蛋白多为多链线性折叠卷曲蛋白,且以线性无链非规则多链卷曲蛋白为主.

关键词：朝仓花椒、DIR基因家族、生信分析

分类号：Q811.4(生物工程学(生物技术))

资助基金：贵州省科技计划项目黔科合计Z字[2012]4008;国家自然科学基金”杜仲松脂醇双糖苷生物合成关键蛋白DIRIGENT编码基因的克隆与功能分析“31660076;贵州省特色植物种质资源利用与创新人才基地

在线出版日期：2020-08-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：21-26