杜仲SQS基因的特征信息分析

摘要：

鲨烯合酶(SQS)是催化植物细胞合成甾醇和三萜类化合物的一种关键酶.为探明杜仲SQS基因家族成员的存在及其特性,本文通过生物信息学分析方法,对杜仲SQS基因(EuSQS)进行发掘,并对其进化关系、基因结构、保守基序、染色体定位、蛋白理化性质、空间结构、调控元件等进行分析.从杜仲基因组数据中获得3条EuSQS基因,它们分布于不同的scaffold上,有5～6个外显子;EuSQS蛋白含396～440 aa,相对分子质量为45.73～49.06 kDa,均属于不稳定蛋白,主要由α-螺旋和无规则卷曲构成;EuSQS1和EuSQS3在结构上较为接近,二者与EuSQS2差异较大;除含有基本元件外,EuSQSs的顺式作用元件还包括光照和激素响应、分生组织表达、逆境胁迫及类黄酮生物合成等六类;在进化关系上,杜仲EuSQSs与产胶植物橡胶草及橡胶树的亲缘关系较近.分析结果为进一步对EuSQS基因的功能鉴定和利用提供了依据.

关键词：杜仲鲨烯合酶基因、萜类化合物、生物信息学、基因结构、功能预测

所属期刊栏目：38

分类号：Q811.4(生物工程学(生物技术))

资助基金：国家转基因生物新品种培育重大专项2016ZX08010003

在线出版日期：2020-03-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1-7