三个猪品种Myf5基因的克隆及序列分析

摘要：

为明确猪Myf5基因的蛋白结构及功能位点,从香猪、大白猪和大白×长白杂交猪背最长肌提取总RNA,采用RT-PCR技术克隆Myf5基因,其cDNA长893 bp,包括完整的开放阅读框768 bp,编码255个氨基酸.将所测序列与GenBank上已知猪种序列进行相似性比较,结果表明:香猪Myf5基因中有3个碱基变异,其中2个突变不改变编码的氨基酸为无义突变,1个突变使其编码的氨基酸由甲硫氨酸(M)变为亮氨酸(L).大白猪没有碱基变化；大白×长白杂交猪Myf5基因中的1个突变,使其编码氨基酸由甘氨酸(E)变为谷氨酸(G).将香猪与其他物种进行核苷酸和氨基酸编码区序列的相似性分析及生物信息学分析.相似性分析表明,香猪Myf5基因氨基酸编码区序列与绵羊、牛、马、兔、黑猩猩、非洲象和小鼠的相似性较高,均在88％以上,推测Myf5基因在哺乳动物具有一定的保守性；Myf5蛋白二级结构以无规则卷曲为主,其次为α螺旋,偶有β转角.预测Myf5蛋白不舍信号肽序列,有29个磷酸化位点.

关键词：香猪、Myf5、基因克隆、序列分析

所属期刊栏目：32

分类号：Q781(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家科技支撑计划项目"高寒山区高效循环养殖优质猪关键技术研究与集成示范"2008BADB5B02;国家863计划课题"中国地方猪种优异特色性状的功能基因组学研究"2013AA102503;贵州省优秀科技教育人才省长专项资金"猪肌细胞生长分化相关基因及调节机制研究"黔省专合字2009-100

在线出版日期：2013-07-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：114-118