抑制剂PMI与MDM2结合模式的分子动力学研究

摘要：

p53-MDM2相互作用已经成为治疗癌症药物设计的重要靶标.采用分子动力学模拟和MM-PBSA方法计算了肽类抑制剂PMI与MDM2的绝对结合自由能,通过基于残基的自由能分解方法计算了MDM2的各残基与PMI的相互作用.结果表明:CH-π、CH-CH和π-π相互作用驱动了PMI在MDM2疏水性裂缝中的结合；相关矩阵的计算表明PMI在一定程度上诱导了MDM2内部的相关运动.

关键词：物理化学、p53-MDM2相互作用、分子动力学模拟、相关矩阵、PMI

所属期刊栏目：28

分类号：O561.5(分子物理学、原子物理学)

资助基金：国家自然科学基金项目11274206;山东省自然科学基金项目ZR2011HM048;山东建筑大学博士科研基金项目XNBS1268

在线出版日期：2013-08-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：101-105