基于生物信息学分析miR-30d-5p在注意缺陷多动障碍发病机制中的作用

摘要：

目的 采用生物信息学方法分析miR-30d-5p在注意缺陷多动障碍(ADHD)发病机制中的作用.方法 通过TargetScan7.2、miRDB和miRTarBase数据库预测miR-30d-5p的靶基因,利用Cytoscape 3.7.1软件中的ClueGO插件对靶基因进行GO和KEGG富集分析,同时通过Cytoscape 3.7.1软件中的STRING插件构建靶蛋白互作(PPI)网络并筛选出核心基因,通过与ADHD gene数据库中已验证的ADHD相关基因对比,分析miR-30d-5p在ADHD中的作用和意义.结果 GO富集显示miR-30d-5p靶基因定位到核质、细胞内细胞器、轴突、细胞膜等细胞结构,并在神经系统中广泛参与到神经元发育、分化、神经元发生的调节、神经元投射发育、顺式调控区结合及顺式调控区序列特异性DNA结合等生物过程.KEGG富集显示miR-30d-5p靶基因显著富集在FoxO信号通路、轴突导向、海马长时程增强和神经营养信号通路.NOTCH1、KRAS、SIRT1、MAPK8、SOCS3、NEDD4、SKP2、BDNF、NEDD4L、SOCS1为miR-30d-5p预测靶基因的PPI网络中的核心基因.与ADHD gene数据库对比结果显示miR-30d-5p预测靶基因有33个基因与ADHD相关,且33个基因中含有预测核心基因BDNF.结论 miR-30d-5p通过靶向调控BDNF基因参与ADHD发生发展的过程,miR-30d-5p有潜力成为ADHD诊疗相关的靶点.

关键词：注意缺陷多动障碍、ADHD、miR-30d-5p、靶基因、生物信息学

所属期刊栏目：33

分类号：R749.94(神经病学与精神病学)

资助基金：国家自然科学基金项目编号:81571359

在线出版日期：2020-09-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：98-103