宫颈癌组织差异表达环状RNA筛选及通路分析

摘要：

目的:筛选宫颈癌组织中差异表达的环状RNA(circular RNA,circRNA),并对其结合的微小RNA(microR-NA,miRNA)及靶向的信使RNA(messenger RNA,mRNA)进行生物信息学分析.方法:从GEO数据库中检索并下载宫颈癌组织芯片数据,利用R 4.1软件进行差异分析,选择表达上调/下调最显著的各5个circRNA,通过circinterac-tome网站预测miRNA和3个生物信息学网站(miRDB、TargetScan、miRTarBase)联合预测靶mRNA,通过Metascape数据库对其进行功能富集分析.应用STRING在线工具预测mRNA的蛋白互作网络并获得关键mRNA,最后预测关键mRNA与患者预后的关系.结果:通过差异分析,发现宫颈癌组织中共有75个差异表达的circRNA,通过上调/下调最显著的共10个circRNA预测获得202个miRNA和5个预后相关mRNA(POLR2D、JUN、CTNNB1、H2AFZ、RBBP7),最后确定了8条circRNA-miRNA-mRNA调控路径可能参与宫颈癌的发生发展.结论:在宫颈癌组织中异常表达的circRNA及其相关通路将可能成为宫颈癌诊断和治疗的新靶点.

关键词：circRNA;miRNA;宫颈癌;通路;GEO数据库

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分类号：R737.33;R730.231;R319(肿瘤学)

资助基金：中华医学会临床药学分会吴阶平医学基金;四川省科技厅国际合作项目;四川省卫生和计划生育委员会科研课题;成都市科技局重点研发支撑计划

在线出版日期：2022-03-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：134-141