肿瘤微环境细胞亚群基因标签预测复发转移性头颈鳞状细胞癌EGFR单抗疗效*

摘要：

目的:利用复发和转移性头颈部鳞癌肿瘤微环境中细胞亚群特征表达基因构建抗EGFR单抗疗效预测模型.方法:通过Gene Expression Omnibus数据库搜集有抗EGFR单抗无进展生存时间( progression free survival,PFS)记录和治疗前肿瘤组织转录组微阵列芯片表达值数据集,并从文献获取肿瘤微环境细胞亚群特征表达基因.发现集中,在长PFS组和短PFS组间分析差异表达基因并计算各个细胞亚群敏感指数.最小绝对值收敛和选择算子(least absolute shrinkage and selection operator,LOSSA)算法筛选与长PFS显著相关的细胞亚群.线性权重法构建抗EGFR单抗敏感评分(anti-EGFR antibodies sensitive score,EASS),并在独立验证集中验证.结果:在GSE65021发现集中,9个细胞亚群中计算得到EASS中位值为30. 73(范围:26. 24~41. 29),ROC曲线表明EASS可完全区别长PFS组人群与短PFS人群(AUC:1. 000,95% CI:1. 000~1. 000,P<0. 001).在GSE102995验证集中,对分期( IV vs II~III)和PS评分校正后,EASS依然是PFS的独立预后因素( HR=0. 647,95% CI:0. 503~0. 831,P=0. 001). EASS对PFS预测准确性的C指数为0. 755(95% CI:0. 719~0. 791),显著高于分期C指数0. 542(95% CI:0. 336~0. 748,P=0. 032).结论:EASS预测模型可很好地预测复发和转移性头颈部鳞癌抗EGFR抗体疗效,值得进一步研究和验证.

关键词：头颈部鳞癌、EGFR单抗、肿瘤微环境、细胞亚群

所属期刊栏目：32

分类号：R739.8;R73-36+2(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金面上项目编号:81572959 This study was supported by The General Program of National Natural Science Foundation of China 81572959

在线出版日期：2019-10-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：773-780