湖州河川沙塘鳢群体线粒体DNA cyt b基因序列的遗传多样性分析

摘要：

河川沙塘鳢具有肉鲜味美,细嫩可口的特点,营养价值与经济价值颇高,是一种极具发展潜力的水产养殖品种,对野生和人工繁育河川沙塘鳢的遗传结构进行检测分析,可为选育和种质保护提供参考资料.本文对湖州河川沙塘鳢(钟管野生群体及八里店养殖群体)的线粒体细胞色素b(cyt b)基因全长进行扩增和测序,并应用生物信息学软件与GenBank中太湖、鄱阳湖和巢湖3个群体的数据进行比较.河川沙塘鳢cyt b基因全长1141bp,4种碱基在所得序列中平均含量为A(26.8％)、G(13.8％)、T(28.0％)、C(31.4％),序列分析显示,cyt b基因序列中变异位点378个,占分析位点的44.26％,含有241个简约信息位点,平均转颠换比值(TS/TV)为0.76.在5个群体138个个体中共检测到75个单倍型,平均单倍型多样性为0.869～1.000,核苷酸多样性为0.01431～0.03848.各群体间遗传距离差异较大(0.01493～0.05868),其中八里店与钟管群体的遗传距离最小(0.01493),而鄱阳湖与巢湖群体的遗传距离最大(0.05868),与构建的聚类图分析结果一致.群体中性检验显示八里店、钟管和太湖的Tajima's D和Fu's Fs值为正值;鄱阳湖和巢湖群体为负值,5个群体Tajima's D和Fu's Fs检验均不显著(P＞0.01).总体上,5个群体间具有较高程度的遗传分化.除了湖州的八里店与钟管群体共享6种单倍型外,其他群体间基本不共享单倍型,这可能是八里店养殖群体亲本来源于钟管野生群体的原因.应用cyt b基因可以明确地将湖州、太湖、鄱阳湖和巢湖群体之间区分开来.

关键词：河川沙塘鳢、线粒体DNA、细胞色素b基因、遗传分化

所属期刊栏目：36

分类号：S917.4(水产基础科学)

资助基金：浙江省农业新品种选育重大科技专项;国家重点研发计划;浙江省青年基金项目;浙江省省属科研院所扶持专项;湖州市自然科学资金项目

在线出版日期：2023-05-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：22-28,35