锦鲤疱疹病毒ORF72基因克隆及结构功能分析

摘要：

于辽宁丹东采集感染锦鲤疱疹病毒的活鲤Cyprinus carpio样品,经DNA提取、PCR扩增、重组质粒构建步骤成功克隆锦鲤疱疹病毒ORF72基因,并利用生物信息学软件分析ORF72蛋白结构与功能,构建系统进化树.结果显示:ORF72基因开放阅读框共1113bp,编码蛋白由370个氨基酸组成,理论相对分子质量为40.5KD;ORF72蛋白主要由α螺旋、β折叠、无规则卷曲3种二级结构组成;N端35个氨基酸序列为信号肽序列.跨膜结构分析表明:ORF72蛋白无跨膜区,保守结构域预测表明ORF72含有一个保守结构域,抗原表位分析表明,抗原性较好.结构预测显示:ORF72氨基酸序列存在2个潜在的N-糖基化位点、1个潜在的O-糖基化位点、19个潜在的磷酸化位点.系统进化树分析发现,其与锦鲤疱疹病毒美国株、以色列株属同一分支.

关键词：锦鲤疱疹病毒、ORF72基因、结构功能分析

所属期刊栏目：29

分类号：S917(水产基础科学)

资助基金：国家科技支撑计划2012BAD26B01;现代农业产业技术体系建设专项资金资助CARS-46-02;中央级公益性科研院所基本科研业务费专项HSY201401

在线出版日期：2016-08-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：9-15