赤眼鳟LGP2序列结构、组织表达及与MDA5互作特征
为探究赤眼鳟遗传学和生理学实验室蛋白 2(laboratory of genetics and physiology 2,LGP2)的功能特征及抗草鱼呼肠孤病毒(grass carp reovirus,GCRV)育种参考潜力,实验克隆获得了 2 940 bp的赤眼鳟lgp2(Sclgp2)全长cDNA和 721 bp的 5′端上游序列.Sclgp2 cDNA编码 680 个氨基酸,包含DEXDc(DExD/H-box helicase domain)、HELICc(helicase superfamily C-terminal domain)和CTD(C-terminal regulatory domain)结构域;其 5′端上游序列含有MafB(muscle aponeurosis fibromatosis B)和IRF3(interferon regulatory factor 3)等转录因子结合位点.不同物种LGP2 的功能结构域、磷酸化修饰位点数具有相似性,同时也存在结构域排布位置及序列的差异.赤眼鳟和草鱼lgp2 cDNA序列比较初步发现 2 个位于RNA结合功能区的GCRV抗性关联位点.系统进化分析显示,赤眼鳟LGP2 先与草鱼、鲫和青鱼聚在一起,再与鲤科鱼类等聚为一大支.荧光定量表达分析显示,赤眼鳟脾脏中sclgp2 表达水平显著高于其他组织,肌肉、心脏中表达量次之,而肠中表达量最低.GCRV感染后,肝脏中ifn1 表达水平在 24～72 h显著下降,其他组织sclgp2 和ifn1 表达水平未有显著变化.相关性分析结果显示,赤眼鳟肌肉sclgp2 与ifn1 表达水平呈极显著正相关(0.999).酵母双杂交互作检测发现,赤眼鳟LGP2 与MDA5 存在弱相互作用,而其DEXDc(1～201 aa)、HELICc(390～476 aa)以及CTD(553～668 aa)结构域与MDA5 无互作.该研究成功获得了sclgp2 全长cDNA及 5′端上游序列,明确了其序列结构、免疫表达及与 MDA5 的互作特征,为赤眼鳟 LGP2 免疫功能属性研究奠定了基础,并为草鱼抗GCRV育种提供了参考.
赤眼鳟、生理学实验室蛋白2(LGP2)、序列结构、表达特征、蛋白互作、GCRV抗性
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Q786;S942.1(基因工程（遗传工程）)
2024-01-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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