基于SSR-seq技术评估中间球海胆多代选育群体和普通养殖群体的遗传多样性
为明确不同选育群体中间球海胆的遗传多样性和遗传结构,利用SSR-seq技术和15个微卫星位点,对1个家系选育群体(FP)、1个群体选育群体(IP)和1个未经选育的普通养殖群体(CP)的遗传多样性及遗传结构进行了分析.结果显示,15个微卫星位点共检测出112个等位基因,FP、IP、CP 3个群体的平均观测等位基因数(Na)分别为5.077、5.133和6.133个,平均有效等位基因(Ne)分别为2.816、2.873和3.638个,平均观测杂合度(Ho)分别为0.522、0.441和0.501,平均期望杂合度(He)分别为0.595、0.599和0.667,平均多态性信息含量(PIC)分别为0.546、0.543和0.623.家系选育群体(FP)He与Ho的差值(0.073)低于IP(0.158)和CP(0.166),平均固定指数(F)(0.115)低于IP(0.248)和CP(0.246).3个群体间遗传分化系数(Fst)介于0.018～0.176,为中低等程度的遗传分化.分子方差分析(AMOVA)结果显示,3个群体的遗传变异主要源于个体间.主成分分析(PCoA)和聚类进化树结果均显示,3个群体之间的亲缘关系较近,其中IP群体遗传分化程度最高.研究表明,3个中间球海胆群体均具有较高的遗传多样性,多代家系选育和群体选育均未明显降低群体的遗传多样性,家系选育更有利于保持群体的杂合度和控制群体的近交水平,群体选育则会提升群体的遗传分化程度.
中间球海胆、选育群体、遗传多样性、遗传结构、微卫星
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Q347;S968.9(遗传学分支学科)
国家重点研发计划;农业科研杰出人才培养计划;创新团队项目;大连市高层次人才创新支持计划项目;辽宁省教育厅面上项目
2023-03-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共11页
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