miRNA在乌鳢水泡病毒感染月鳢细胞(SSN-1)中的表达变化及其调控作用

摘要：

为了探究microRNA(miRNA)对乌鳢水泡病毒(snakehead vesiculovirus,SHVV)感染月鳢细胞(striped snakehead cell,SSN-1)的影响,本研究对SHVV感染的SSN-1细胞及未感染的细胞进行miRNA高通量测序.分别用U6、β-actin和5S rRNA作为内参基因研究SHVV感染对细胞内22个高丰度(transcripts per million,TPM≥1000)miRNA表达水平的影响,结果显示,U6基因作为内参时,SHVV感染对β-actin没有显著影响,但是5S rRNA显著上调表达,说明U6和β-actin基因适合作为内参基因研究SHVV感染对miRNA表达水平的影响.此外,我们研究了14种miRNA对SHVV增殖的影响.结果发现,miR-27a-3p、miR-26a-5p、miR-30e-3p等11种miRNA显著促进SHVV增殖,miR-150和miR-216b显著抑制SHVV增殖.进一步研究发现高丰度的miR-100-5p在SHVV感染SSN-1细胞早期上调表达,晚期下调表达.过表达miR-100-5p可以显著抑制SHVV的增殖,而抑制表达miR-100-5p可以显著促进SHVV的增殖.本研究为开发抗SHVV的核酸药物提供了理论基础.

关键词：乌鳢水泡病毒、SSN-1细胞、miR-100-5p、抗病毒

所属期刊栏目：43

分类号：S941.41;Q786(水产保护学)

资助基金：国家自然科学基金31602195

在线出版日期：2019-06-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：1288-1297