斑点叉尾鮰BPI1基因的原核表达及生物信息学分析
为探究斑点叉尾鮰BPI1抗菌肽基因编码蛋白的结构特征,实验提取斑点叉尾鮰肾脏RNA,根据BPI1基因序列设计引物,利用PCR方法克隆BPI1基因并构建至原核表达载体pTWIN1中.构建成功的重组质粒pTWIN1-BPI1经原核表达,SDS-PAGE检测显示得到约为50ku的融合蛋白,与预期结果相一致.通过生物信息学软件对BPI1基因编码的蛋白序列进行分析,结果显示,克隆所得斑点叉尾鮰BPI1基因编码一条由223个氨基酸残基组成的多肽,等电点为9.07,属于BPI超家族,是稳定的亲水蛋白.亚细胞定位BPI1分布在线粒体(43.5%)、细胞质(30.4%)和细胞核(26.1%)中,表明BPI1可能在嘌呤和嘧啶合成以及能量代谢等过程中发挥信号转导、促进生长等重要作用.二级结构以α-螺旋和β-折叠为主,三级结构呈棒状.同源性及进化树分析表明,实验所得BPI1基因序列与斑点叉尾鮰BPI抗菌肽基因的同源性最高,序列一致性为99.1%,进化树聚为一支,表明BPI1基因编码的蛋白序列在相同物种中的突变率较低,保守性较高,相同物种中其生物活性与个体间的差异关系较小.
斑点叉尾鮰、BPI1基因、原核表达、生物信息学分析
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Q785;S941.42(基因工程(遗传工程))
四川省科技厅应用基础项目2014JY0143;教育部“长江学者和创新团队发展计划”创新团队项目IRT0848Sichuan Science and Technology Agency Application Foundation Project 2014JY0143;Program for Changjiang Scholars and Innovative Research Teams in the University IRT0848
2017-03-20(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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