鲂属鱼类线粒体基因组的比较及其系统发育分析
基于GenBank中团头鲂线粒体基因组全序列和三角鲂、厚颌鲂、广东鲂的部分线粒体基因组序列,设计引物扩增出三角鲂、厚颌鲂和广东鲂3种鱼线粒体基因组全序列,同时对4种鲂属鱼类线粒体基因组全序列进行了比较分析.结果表明,4种鲂属鱼类线粒体基因组基因排列顺序完全相同,排列紧密,均包含13个蛋白质编码基因、22个tRNA、2个rRNA、1个非编码控制区(D-loop区)和1个轻链复制起始区(OL区).除ND6和8个tRNA在L链上编码外,其余的基因均在H链上编码.4种鲂属线粒体基因组13个蛋白质编码基因中,均呈现出较强的A+T偏向性和C碱基偏好.全序列比对结果显示,共有758个变异位点,其中非简约性信息位点有691个,占总变异位点的91.16％,简约性信息位点有67个,仅占总变异位点的8.84％.22个tRNA基因中只有1 1个存在种间变异,共23个变异位点,主要发生在tRNA三叶草结构的TψC和DHU臂环上.13个蛋白质编码基因中共检测出626个变异位点,这些变异主要发生在密码子第三位,占总变异位点的82.59％,其中变异位点数最多的是Cyt b基因,达84个,其次是ND 4基因(83个).因此,Cyt b和ND4基因可作为备选的分子标记,用于鲂属群体间的遗传学研究.基于4种鲂属鱼类线粒体基因组全序列构建的ML树和BI树均显示,三角鲂与厚颌鲂的亲缘关系最近,团头鲂与它们的亲缘关系相对较近,而广东鲂与前述3种鲂属鱼类的亲缘关系均较远.
鲂属、线粒体基因组、变异位点、分子标记、系统发育
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Q343.1;S965(遗传学分支学科)
国家自然科学基金项目31201988;现代农业产业技术体系建设专项CARS-46-05;中央高校基本科研业务费专项2011PY023,2011SC27,2011ZC011,2012YB08,2011QC030
2014-04-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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