中华鳖3个地理群体线粒体基因D-loop区遗传多样性分析

摘要：

采用PCR结合DNA测序技术和SSCP技术,分析了中华鳖3个地理群体线粒体DNA(mtDNA) D-loop区部分序列的变异及遗传多样性.在25个个体中,其碱基组成为A+T的平均含量(65.4％)高于G+C(34.6％),共检测到变异位点7个(约占总位点数的5.7％),转换/颠换值为2.76.核苷酸多样性(π)为0.019 95,平均核苷酸差异数(K)为2.453.25个个体分属6个单倍型,单倍型多样度(Hd)为0.707,单倍型间的平均遗传距离(P)为0.027.6个单倍型构建的UPGMA系统树聚为3个分支.结果表明,中华鳖群体mtDNA D-loop区序列存在着较丰富的变异和遗传多样性,日本鳖的遗传多样性比黄河鳖和黄沙鳖丰富,黄沙鳖与日本鳖、黄河鳖的遗传距离较远.而且PCR-SSCP可以检测到两种类型的电泳图谱,其中Ⅱ型均为日本鳖,该技术可用于78位TT←→AA颠换变异位点的检测.

关键词：中华鳖、线粒体DNA、D-loop区、遗传多样性、PCR-SSCP

所属期刊栏目：36

分类号：Q347;S917(遗传学分支学科)

资助基金：国家科技攻关计划2006C12011

在线出版日期：2012-05-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：17-24