三角帆蚌CAT基因cDNA全长克隆及表达分析
采用RT-PCR和cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE)首次克隆了三角帆蚌过氧化氢酶(CAT)基因的cDNA全长序列,为2 804bp,包含112bp的5'非翻译区(untranslated region,UTR),1 303bp的3'UTR和1 388 bp的开放阅读框(open reading frame,ORF).ORF区共编码462个氨基酸,推算的分子量约为52.7 ku,理论等电点为6.35.多序列比对结果显示,有一段CAT氨基酸高度保守的催化位点序列FDRERIPERVVHAKGAG.三角帆蚌CAT基因有12个与还原型辅酶Ⅱ(NADPH)结合的氨基酸残基,分别是Asp107、His153、Phe157、Ser160、Arg162、Asn172、Try174、Lys196、Val261、Trp262、His264和Try317,其中第261位和第264位的氨基酸在不同物种间有所区别.比对结果得到的三角帆蚌CAT基因的氨基酸序列,与软体动物的CAT基因相似性高达99%,与虾类、鱼类、两栖类、哺乳类的CAT基因相似性也达到98%~99%,可推断属于CAT3.利用CAT基因推断得到的氨基酸序列构建NJ系统树,分析显示三角帆蚌首先与软体动物聚在一起,再与虾类聚在一起,然后依次与鱼类、两栖类和哺乳类聚在一起.荧光定量结果显示,CAT基因在三角帆蚌的7个组织均有表达,其中在肾中的表达量极低,在血液中表达呈上调趋势且明显区别于其他组织,在另外5个组织中总体上呈现不统一的先上调后下调的趋势.
三角帆蚌、过氧化氢酶(CAT)、基因表达、RACE-PCR
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Q785;S917(基因工程(遗传工程))
国家重点基础研究发展计划(973计划);国家自然科学基金;国家科技支撑计划;上海市科委地方院校能力建设项目
2011-08-05(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
481-492