非酒精性脂肪肝差异基因的生物信息学分析

摘要：

目的:采用生物信息学方法筛选非酒精性脂肪肝(Non-alcoholic fatty liver disease,NAFLD)的差异基因(Differentially expressed genes,DEGs),为临床寻找相关分子标志物提供理论基础.方法:从基因表达数据库(Gene expression omnibus database,GEO)中获取NAFLD相关基因芯片GSE33814,通过GEO2R筛选DEGs,用R语言对DEGs进行基因本(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,通过STRING数据库建立蛋白互作分析(Protein-Protein Interaction,PPI),筛选关键基因.通过NetworkAnalyst数据库构建靶基因-miRNA网络和靶基因-转录因子(Transcription factors,TF)网络.结果:经筛选共获得193个DEGs,主要富集于中性粒细胞的活化及免疫反应等生物功能方面,且参与柠檬酸循环等信号通路.PPI筛选10个关键基因.结论:筛选所得的DEGs可能在NAFLD的发生发展中发挥重要作用,有望成为NAFLD早期筛查、诊断的生物学靶标.

关键词：非酒精性脂肪肝、差异表达基因、生物信息学分析

所属期刊栏目：44

分类号：Q786;S852.65;R739.4

资助基金：天津市卫生健康委员会科技项目TJWJ2021QN063

在线出版日期：2022-09-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1317-1321