家兔肌肉组织中保守miRNA的鉴定及进化分析

摘要：

[目的]旨在鉴定家兔肌肉组织中的保守miRNA,获取其表达谱并分析其进化特征,进而为研究保守性miRNA在家兔生长发育过程中的生物学功能提供理论依据.[方法]采用Solexa技术对家兔背最长肌组织中miRNA进行了测序和分析.[结果]通过序列比对鉴定出521个保守的miRNA序列,分属于238个不同的家族.其中miR-1、miR-133、miR-206和miR-499等肌肉特异性表达的miRNA在肌肉中均有表达,且除miR-499外的其它3个miRNA在所测定样本中均高表达.10个动物保守性miRNA家族在S86专门化父系肌肉基因组中出现了丢失.靶基因显著富集于13条信号通路,其中Focal adhesion和PI3K-Akt信号通路与肌肉发育密切相关.[结论]研究鉴定的影响肌肉发育的miRNA及其靶基因富集通路,将有助于家兔生长调控机制的研究,加快可用于标记辅助选择的分子标记的开发.

关键词：家兔、Solexa测序、微小RNA、生物信息学方法

所属期刊栏目：41

分类号：S829.1(家畜)

资助基金：科研院所科技成果转化项目;四川省畜牧科学研究院基本科研业务专项;四川省科技计划项目;四川省自然科学基金;现代农业产业技术体系;四川省畜牧科学研究院基本科研业务专项

在线出版日期：2023-09-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：713-718