芥菜全基因组中Hsf基因家族鉴定与分析

摘要：

[目的]通过鉴定与分析芥菜基因组中Hsf转录因子家族成员,为芥菜Hsf基因功能研究与遗传改良提高抗逆性提供理论依据.[方法]利用生物信息学方法分析芥菜Hsf热激转录因子家族成员的功能结构、保守基序、启动子顺式作用元件、系统进化、共线性及采用RNA-seq验证Hsf低温胁迫的基因表达.[结果]芥菜基因组中鉴定出71个Hsf基因家族成员,分布于18条染色体上,归类为3个亚家族,蛋白均含有DBD和HR-A/B结构域.BjuHsf启动子区域包含与逆境胁迫、激素、生长发育等相关顺式作用元件.系统进化与共线性分析表明,芥菜Hsf家族成员与大白菜Hsf家族成员具有更近的亲缘关系.在低温胁迫下,BjuHsf基因表达分析表明8个BjuHsf基因显著上调表达.[结论]这些显著差异表达BjuHsf基因与芥菜抗寒性极其相关,可作为芥菜耐寒性遗传改良的候选基因.

关键词：芥菜、热激转录因子、生物信息学、表达分析

所属期刊栏目：41

分类号：S637(蔬菜园艺)

资助基金：贵州省科技计划项目;国家自然科学基金;贵州省基层农技推广体系改革与建设补助项目;贵州省蔬菜现代农业产业技术体系项目;贵州省农科院资源专项;贵阳市蔬菜种质资源研究中心建设项目

在线出版日期：2023-05-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：295-306