芹菜TCP基因家族全基因组鉴定、进化分析和表达研究

摘要：

[目的]鉴定芹菜基因组中TCP转录因子基因家族成员,为开展芹菜TCP基因功能研究及遗传改良提供理论依据.[方法]基于芹菜全基因组数据,对TCP家族成员进行了鉴定,系统分析了该家族成员的理化性质、基因结构、蛋白功能域、染色体分布、系统进化和转录表达丰度等,并采用qRT-PCR验证TCP参与了高温胁迫的应答.[结果]芹菜中共鉴定出29个TCP基因,将其划分为2个大的亚族ClassⅠ与ClassⅡ;TCP家族绝大多数基因位于染色体上且分布不均,只有2个基因位于重叠群上;所有成员均含有保守的结构域;进化分析发现伞形科作物的TCP基因亲缘关系较近;TCP家族成员的启动子区域显著富集与生长发育、激素响应和逆境应答相关的顺式元件;TCP家族大多数基因在芹菜叶片中高表达,且在白色、绿色和红色芹菜中的表达丰度都较高,且ClassⅠ亚族还参与了高温胁迫的应答.[结论]研究结果有助于进一步了解芹菜TCP家族成员的系统进化和基因功能,为今后芹菜的基因工程改良提供了一定的理论基础.

关键词：芹菜、TCP转录因子、系统进化、表达分析、高温胁迫

所属期刊栏目：40

分类号：S637.3(蔬菜园艺)

资助基金：国家自然科学基金32002027

在线出版日期：2022-05-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：145-155