山羊EDNRA基因编码区克隆与组织表达规律分析

摘要：

[目的]旨在探究EDNRA基因在山羊心脏、肝、脾、肺、肾、大脑、网膜脂肪组织中的表达情况.[方法]采用克隆、测序的方法得到山羊EDNRA基因CDS全长的碱基序列,用生物信息学软件进行序列分析、亲水性/疏水性分析、潜在的信号肽位点分析、亚细胞定位分析、蛋白质的二级结构和三级结构预测及系统进化树分析,最后采用实时荧光定量PCR(qPCR)测定EDNRA基因在山羊心脏、肝、脾、肺、肾、大脑、网膜脂肪组织中mRNA的表达量.[结果]成功克隆了EDNRA的CDS序列,得到山羊EDNRA基因包含一个1 284 bp的最长开放阅读框.该序列编码427个氨基酸,含信号肽序列(第1到第20位氨基酸)以及7型跨膜受体同系物结构域.基因编码产物具有疏水性,属分泌蛋白,有35个磷酸化修饰位点.二级结构主要为α-螺旋.系统进化树分析表明,山羊EDNRA基因和绵羊、牛以及野牛的亲缘关系较近.qPCR结果表明,山羊EDNRA基因在心脏中的表达量最高,在肝、脾、肾、大脑、网膜组织中的表达量较低,而在肺中表达最少.[结论]EDNRA可能在心脏行使功能过程中发挥重要作用.

关键词：EDNRA基因、CDS区序列分析、蛋白结构预测、组织表达规律、山羊

所属期刊栏目：37

分类号：S811.5(普通畜牧学)

资助基金：国家重点研发计划项目;国家自然科学基金地区科学基金项目

在线出版日期：2020-05-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：852-859