红螯螯虾转录组高通量测序及分析

摘要：

[目的]为发掘和研究红螯螯虾功能基因SSR标记奠定基础.[方法]对红螯螯虾肝脏、精巢以及卵巢转录组测序选用新一代高通量测序技术Illumina Hi Seq 2000,同时借助生物信息学法展开基因表达谱探究及功能基因预测.[结果]肝脏组织获得47629414条clean reads,精巢组织获得47018968条clean reads,卵巢组织获得53267362条clean reads.所有reads组装后获得了67369个Unigene.通过GO分类,16989个Unigene被分为3个种类,即生物学过程、细胞组分、分子功能.通过COG分类,4697个Unigene被分为25个种类.通过KEGG分类,9842个Unigene分属331个代谢途径.[结论]通过对红螯鳌虾肝脏等3个组织转录组的测序,获得了其相关基因的表达图谱及其功能分类.

关键词：红螯螯虾、转录组、高通量测序

所属期刊栏目：37

分类号：S917.4(水产基础科学)

资助基金：湖州市公益性应用研究项目2016GY14;现代农业产业技术体系专项资金资助CARS-48-09C;浙江省省属科研院所扶持专项2017F10016

在线出版日期：2019-05-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：241-246,265