绿尾虹雉(Lophophorus lhuysii)Toll样受体5基因的克隆和适应性进化分析

摘要：

[目的]获得绿尾虹雉(Lophophorus lhuysii)Toll样受体5基因(TLR5)编码区序列,并对其编码区蛋白的特征及适应性进化进行分析.[方法]以绿尾虹雉基因组DNA为模板,采用PCR扩增克隆获得TLR5基因编码区序列.使用MEGA、PAML等软件对其序列特征及选择压力进行分析.[结果]绿尾虹雉TLR5基因编码区序列全长2583 bp,共编码860个氨基酸,以亮氨酸含量最高(133/860),色氨酸含量最低(11/860).编码蛋白为典型的Ⅰ型跨膜结构,包括富含LRRs结构域的胞外区、跨膜区和胞内TIR结构域.绿尾虹雉TLR5基因极其保守,与雉鸡(P.colchicus)的同源性最高(97.75％),与小白鹭(E.garzetta)同源性最低(85.17％).采用位点-特异模型在胞外区共检测到3个正选择氨基酸位点(263F,280K和645I).[结论]绿尾虹雉TLR5基因编码区受到较强的纯净化压力,胞外区LRRs结构域可能为识别病原微生物的区域.

关键词：绿尾虹雉、TLR5基因、克隆、适应性进化

所属期刊栏目：37

分类号：S722.3(造林学、林木育种及造林技术)

资助基金：四川省教育局创新研究小组计划项目14TD0002

在线出版日期：2019-05-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：232-240