白桦BpERF1和BpERF2基因的克隆与表达模式分析

摘要：

[目的]对白桦BpERF1和BpERF2基因进行生物信息学分析及非生物胁迫下的表达模式分析,为白桦抗逆育种提供重要基因源和理论依据.[方法]从白桦转录组数据库中找到2条ERF基因,通过生物学网站及软件对其进行生物信息学分析;通过RT-PCR分析盐和干旱胁迫下2个ERF基因的表达模式.[结果]BpERF1蛋白含有2个核定位信号,BpERF2蛋白含有1个核定位信号;两个ERF蛋白的结构域均含有3 个反向平行的β折叠和一个α螺旋;BpERF1和BpERF2都属于ERF亚家族成员;在NaCl胁迫下,BpERF1基因在根和叶中的相对表达量与对照相比呈上调表达的趋势;BpERF2基因在根茎叶中均呈下调表达的趋势;在PEG胁迫下,两个基因的表达模式与NaCl相似.[结论]生物信息学分析结果推测BpERF1和BpERF2基因可能参与植物对生物和非生物胁迫的应答;2个ERF基因均可以不同程度地被高盐和干旱胁迫所诱导,但不同ERF基因在胁迫下的表达模式存在差异,ERF基因的表达具有组织特异性,说明2个ERF基因可能通过不同的调控机制来应答逆境胁迫.

关键词：白桦、ERF基因、生物信息学、表达模式

所属期刊栏目：36

分类号：S722.3(造林学、林木育种及造林技术)

资助基金：国家自然科学基金青年项目31600532;黑龙江省大学生创新创业训练计划项目201610223038

在线出版日期：2018-08-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：329-336