利用SLAF-seq技术开发新寡核苷酸探针鉴定小麦背景中的黑麦染色体

摘要：

【目的】通过荧光原位杂交（FISH）技术能有效地检测小麦背景中的黑麦染色体，进一步发现利用寡核苷酸探针和非变性FISH（ND-FISH）技术可以提高黑麦染色体的检测效率。【方法】通过借助SLAF-seq（specific length amplified fragment sequencing）和生物信息学方法开发寡核苷酸探针。【结果】开发了3种新的寡核苷酸探针Oligo-2874、Oligo-5296和Oligo-9965，它们可用于ND-FISH分析。通过与小麦背景中的黑麦染色体端部和亚端部特异杂交，从而达到识别黑麦染色体的目的。【结论】这些寡核苷酸探针可以用于快速高效地鉴定小麦背景中的黑麦染色体，丰富了小麦-黑麦杂交后代FISH分析的探针源。研究结果也表明SLAF-seq技术可以用来开发小麦近缘种属特异的重复序列FISH分析探针。

关键词：小麦、黑麦、寡核苷酸探针、非变性FISH、SLAF-seq

所属期刊栏目：34

分类号：S512.5(禾谷类作物)

资助基金：国家自然科学基金项目31471498。

在线出版日期：2017-02-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：402-405