长毛兔Hoxa4基因多态性及其与产毛量关联性分析

摘要：

【目的】分析苍溪长毛兔Hoxa4基因第2外显子遗传多态性及其与产毛量的相关性，发现与产毛量相关的分子标记，为加快毛兔选育提供参考。【方法】采用PCR产物直接测序法对208只苍溪长毛兔Hoxa4基因第2外显子进行遗传变异检测，并运用SAS 8.1软件对苍溪长毛兔Hoxa4基因遗传变异与产毛量进行关联性分析。【结果】苍溪长毛兔Hoxa4基因第2外显子存在1个SNP位点（c.294T>C），该突变导致氨基酸由Ser-Pro（TCC-CCC）转变，共检测到TT、TC、CC三种基因型。其中TC基因型为优势基因（0.5962），T为优势等位基因（0.5629）。对突变位点的群体遗传参数分析发现：杂合度为0.4944，有效等位基因数为1.9779，多态信息含量（0.3722）处于中度多态，说明Hoxa4基因在苍溪长毛兔中具有较高遗传变异能力，有持续选育的潜力实现兔群遗传改良。关联性分析发现携带CC基因型的个体73日龄产毛量显著高于TC型（P<0.05），且146日龄阶段产毛量显著高于TT型（P<0.05），极显著高于TC型（P<0.01）。【结论】Hoxa4基因第2外显子突变可作为评定苍溪长毛兔产毛量的遗传标记。

关键词：长毛兔、Hoxa4基因、产毛量、单核苷酸多态性、关联分析

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分类号：S829.1(家畜)

资助基金：四川省“十二五”畜禽育种攻关项目2011NZ0099-4；国家现代农业技术体系项目CARS-44-A-2；国家级大学生创新训练计划项目201510626025。

在线出版日期：2016-07-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：239-244