10.16036/j.issn.1000-2650.2016.02.019
PRRSV-GP5基因的克隆及其B细胞抗原表位预测与分析
【目的】研究PRRSV-GP5基因B细胞抗原表位性质。【方法】根据GenBank上发表猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)ATCC VR-2332的全基因序列,设计并合成引物,采用RT-PCR技术,对阳性病料扩增回收,并将其克隆入pMD18-T载体中,送上海生工测序。应用生物信息学同源模型化的方法建立其PRRSV-GP5蛋白3D结构,并根据生物信息学软件DNAStar预测PRRSV-GP5蛋白的二级结构、表面可及性、抗原指数、亲水性及柔韧性,综合分析预测其B细胞抗原表位。【结果】结果表明,其肽段30-36、50-55、140-142、146-151和196-198可能是其优势B细胞抗原表位区域。【结论】该基因高度保守,PRRSV-GP5蛋白呈现较规则的空间结构,同时该结果将为PRRSV-GP5蛋白体外表达产物的应用和基因工程疫苗的研究提供理论依据。
PRRSV-GP5、克隆、抗原表位
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Q518.2(蛋白质)
河南省教育厅项目14A180009。
2016-07-21(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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