鸭YAP 1基因编码区的克隆、生物信息分析及其组织表达特性

摘要：

【目的】旨在克隆鸭YAP 1基因，预测其蛋白结构、功能及其组织表达特性。【方法】以北京肉鸭为材料，采用RT-PCR 技术克隆鸭YAP 1基因 CDS 区，利用多种生物信息学分析软件预测其结构与功能，并应用荧光定量 PCR检测其组织表达特性。【结果】结果表明：鸭YAP 1基因 CDS 全长1248 bp，编码415个氨基酸，氨基酸水平上与鸡相似性最高，达99．7％；氨基酸序列分析发现鸭 YAP1蛋白相对分子量为45417．5 Da，主要定位在细胞核，属水溶性蛋白，不属于分泌蛋白；预测鸭 YAP1氨基酸含有磷酸化、糖基化位点各30个；含两个 WW 结构域，且不同物种间结构域较保守；二级结构以无规则卷曲为主，三级结构呈弯曲状螺旋结构；荧光定量结果显示，YAP 1在胰脏中表达量最高，肌肉组织中最低。【结论】鸭YAP 1基因非常保守，结构、功能与哺乳动物具较高一致性。

关键词：鸭、YAP1基因、生物信息学分析、荧光定量PCR

分类号：S834+.81(家禽)

资助基金：四川省“十二五”农作物及畜禽育种攻关项目．水禽配套系选育2011NZ0099-8。

在线出版日期：2015-04-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：71-77,88