野生二粒小麦低分子量谷蛋白基因序列分析

摘要：

根据低分子量谷蛋白亚基(LMW-GS)基因编码区保守序列设计引物,用PCR方法从蛋白质含量低至13.17%的D81和高达27.20%的D42 2份野生二粒小麦(Triticum dicoccoides)中克隆得到2个LMW-GS基因序列LMW-D81和LMW-D42(GenBank 上的序列号分别为FJ461691和FJ461690).它们具有小麦低分子量谷蛋白基因的典型结构特征,其长度分别为1053bp和1011bp,并分别编码350和336个氨基酸残基的成熟蛋白.LMW-D42和LMW-D81的氨基酸序列估算分子量分别为38kDa和39kDa,说明二者均为C型亚基编码基因.LMW-D42和LMW-D81的N-末端序列都为METSHIP-,表明这2个C型亚基编码基因归属LMW-m型.同源性比对和聚类分析揭示,LMW-D81和LMW-D42均属于Glu-B3位点编码基因.LMW-D42和LMW-D81的核苷酸序列和推导的氨基酸序列一致性分别为93.94%和92.57%.与LMW-D81相比,LMW-D42除发生了22处间断性的碱基替换外,还存在一段42个碱基的缺失.对推导氨基酸序列进行的二级结构预测显示,LMW-D81和LMW-D42的蛋白质二级结构高度一致.其α-螺旋主要位于信号肽和C-末端,少量的α-螺旋和不规则卷曲构成了N-末端.大多数不规则卷曲位于重复区,仅有的一段β-折叠则出现在C-末端.同时,它们的编码区均具有分布一致的8个半胱氨酸残基,且第一和第七个半胱氨酸残基均位于无规则卷曲中.这些结构特点对小麦加工品质改良具有一定意义.

关键词：野生二粒小麦、低分子量谷蛋白、基因克隆、序列分析、二级结构

所属期刊栏目：26

分类号：S512.1(禾谷类作物)

资助基金：国家自然科学基金30571139;四川省教育厅重点项目;四川省学术和技术带头人培养基金

在线出版日期：2009-04-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：385-392