野生和养殖丁肠道微生物菌群的比较分析

摘要：

鱼类肠道菌群的结构和功能对其生长发育起重要作用.丁(鱥)是我国新疆地区特有的经济养殖鱼类,为评估野生丁(鱥)和养殖丁(鱥)肠道微生物菌群的结构和差异,以野生丁(鱥)和养殖丁(鱥)作为研究对象,采用Illumina Miseq高通量测序方法对其肠道16S rRNA基因的V3～V4区进行测序,比较两种环境条件下丁(鱥)肠道微生物菌群结构的丰度变化和差异.试验结果显示,丁(鱥)肠道微生物的优势菌群主要为变形菌门、厚壁菌门、放线菌门和拟杆菌门.但在两种环境下,其肠道菌群结构存在明显差异:在门水平下,梭菌门和酸菌门在养殖丁(鱥)中的丰度显著低于野生丁(鱥)(P<0.05);在属水平下,乳酸杆菌属和不动杆菌属在养殖丁(鱥)中的丰度高于野生丁(鱥),而支原体和黄杆菌属则显著低于野生丁(鱥)(P<0.01);在种水平下,洛菲不动杆菌在养殖丁(鱥)中的含量显著高于野生丁(鱥)(P<0.01),而未分类的黄杆菌则显著低于野生丁(鱥)(P<0.05).试验结果表明,由于饲养环境的改变,野生丁(鱥)和养殖丁(鱥)肠道菌群的组成及丰度出现显著变化.该结果可为后续丁(鱥)肠道微生物的研究和养殖管理提供基础数据和参考.

关键词：丁(鱥)、肠道微生物、环境

所属期刊栏目：42

分类号：S917.1(水产基础科学)

资助基金：新疆生产建设兵团科学技术局项目2016AC027

在线出版日期：2023-02-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：128-135