辽宁沿海鲬mtDNA控制区结构和遗传多样性分析

摘要：

用PCR扩增直接测序的方法,获得辽宁沿海25尾鲬线粒体DNA控制区基因的876～878 bp全序列.通过GenBank中已有的鲬属鱼类控制区同源序列比对及形态特征分析发现,辽宁沿海鲬实为褐斑鲬而非印度鲬.同时,利用高度变异的控制区序列,对辽宁沿海褐斑鲬进行序列多态性分析和遗传多样性分析.结果显示,25尾褐斑鲬间共有22个变异位点,辽宁沿海褐斑鲬群体的遗传多样性处于中等偏低水平,单倍型多样性指数和核苷酸多样性指数分别为0.92±0.04和0.0026±0.0017.核苷酸不配对分析表明,辽宁沿海褐斑鲬群体在19000～63000年前经历了群体扩张.对比其他已报道鱼类控制区的结构识别序列,对鲬属鱼类控制区的结构进行分析,识别了终止序列区、中央保守区和保守序列区,并找到DNA复制终止相关的序列ETAS,中央保守区的保守序列CSB-F、CSB-E、CSB-D以及保守序列区的保守序列CSB1、CSB2、CSB3.这一结果可为将来全面了解鲬的种群分化研究及其物种资源保护提供基础资料.

关键词：褐斑鲬、线粒体DNA控制区序列、结构、遗传多样性

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分类号：Q346.5(遗传学分支学科)

资助基金：国家重点研发计划项目2017YFC1404400;国家自然科学基金面上项目31770458;辽宁省海洋与渔业科研项目201401

在线出版日期：2018-12-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：818-824