长尾草金鱼成熟期雌雄性腺 RN A-Seq 转录组分析

摘要：

为探究长尾草金鱼成熟期雌雄性腺的RNA‐Seq转录组，运用Illumina RNA测序技术，对长尾草金鱼成熟期性腺分别进行了转录组测序。其中卵巢经两端测序共获得清洁数据61769892条，含有6．18G碱基，平均错误率0．03％，左右端测序GC含量分别为51．15％和51．2％。精巢经两端测序共测得清洁数据69557514条，含有6．96G碱基，平均错误率0．03％，左右端测序GC含量分别为48．91％和49．44％。两个转录组数据混合拼接后得到170245个转录本，共80591个独立基因。将上述独立基因与多个数据库进行比对，得到注释的基因为51364条，占总数的63．73％。基因本体分类中，细胞过程、细胞、绑定等二级分类为条数较多分类项。转录组数据经筛查共得到17347个微卫星标记和363416个单核苷酸多态性标记。两个转录组基因表达量差异比较结果显示，雌雄样本间表达差异基因共6317个。上述工作不仅为该种的基因克隆和标准及筛选提供了基础数据，也为分子水平阐明其性腺分化和发育机理打下了基础。

关键词：金鱼、性腺、转录组、微卫星、单核苷酸多态性

分类号：S917.4(水产基础科学)

资助基金：国家科技基础条件平台建设运行项目2014DKA30470；北京市自然科学基金资助项目6112008；现代农业产业技术体系北京市观赏鱼创新团队建设项目．

在线出版日期：2015-02-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：800-806