慢性密度胁迫对绿鳍马面鲀肌肉转录组的影响

摘要：

为了解慢性密度胁迫下绿鳍马面鲀(Thamnaconus septentrionalis)肌肉组织的分子响应机制,挖掘密度胁迫下的相关信号通路和差异表达基因,设置 2 个养殖密度组(即 100 尾/m3 的中密度组和 500 尾/m3 的高密度组)对绿鳍马面鲀肌肉转录组进行了研究.分别于第 25 天和第 50 天时获得养殖绿鳍马面鲀的肌肉组织,利用Illumina测序平台对肌肉组织样本进行了转录组测序,得到 103.3 Gb高质量测序数据.对照开始时暂养的绿鳍马面鲀,各试验组均筛选出大量的差异表达基因.通过GO(Gene Ontology)功能注释与KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)功能富集分析,筛选出涉及破骨细胞分化、MAPK、PI3K-Akt等路径以及黏着斑相关的信号传导机制,发现 nfatc1、tgfbr2、map3k14、pparg、fos、flna、flnc、fn1、tln1、thbs1 等关键基因在绿鳍马面鲀肌肉组织中的差异性表达.研究表明,这些差异表达基因可能在调节绿鳍马面鲀的细胞生长和分化、免疫能力等方面发挥关键作用.

关键词：密度胁迫、基因表达、转录组、绿鳍马面鲀、养殖

所属期刊栏目：51

分类号：R737.9;S828.2;R329.24

资助基金：上海市自然科学基金19ZR1470100

在线出版日期：2024-01-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：29-37