刀鲚MSTN基因遗传多态性与生长性状的关联分析
为筛选刀鲚(Coilia ectenes)生长性状遗传改良的分子遗传标记,基于现有刀鲚转录组数据,利用基因克隆技术获得养殖刀鲚肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)基因的全长序列,采用PCR产物直接测序和SNaPshot技术分别进行基因多态性的筛选和分型,并将不同基因型与刀鲚的生长性状(体长、体高和体质量)进行关联分析.结果显示,养殖刀鲚MSTN基因的DNA序列主要由2个内含子和3个外显子组成,经SNP位点筛选,仅在第1内含子上筛选到2个颠换突变位点(g.564G>T和g.755G>T)和1个转换突变位点(g.786C>T);将3个SNP位点与生长性状进行关联分析发现,SNP位点g.786C>T与刀鲚的体长、体高和体质量呈显著性负相关,具有TT基因型个体的体长、体高和体质量显著低于CC型和CT型(P<0.05),而SNP位点g.564G>T和g.755G>T的不同基因型仅与刀鲚的体高具有一定程度的相关性;3个SNP位点对养殖刀鲚的群体遗传分析显示,刀鲚养殖群体的观测杂合度(HO)、期望杂合度(HE)和多态信息含量(PIC)分别为0.280～0.480、0.332～0.455和0.277～0.351,3个SNP位点均属于中度多态(0.25<PIC<0.50),能够应用于刀鲚养殖群体的群体遗传分析.研究结果表明,刀鲚MSTN基因的SNP位点g.786C>T有望作为剔除劣质刀鲚繁育亲本的候选分子标记.
刀鲚、MSTN基因、生长性状、单核苷酸多态性、关联分析
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上海市科技兴农重点攻关项目[沪农科攻字;第6-2-2 号;上海市科学技术委员会自然科学基金
2021-03-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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