椰子CnRADIALIS-like转录因子的克隆与表达分析

摘要：

本研究依据前期已经完成的4个品种椰子外果皮转录组测序数据结果,筛选获得在4个品种椰子外果皮中表达水平显著差异的MYB类基因CnRADIALIS-like.从椰子(Cocos nucifera L.)外果皮中克隆获得CnRADIALIS-like,序列分析显示,CnRADIALIS-like基因的开放阅读框(ORF)长288 bp,编码95个氨基酸.结构域分析显示,CnRADIALIS-like含有1个典型的SANT/MYB结构域,属于MYB转录因子家族中的I-box-binding-MYB型.多序列比对发现,CnRADIALIS-like氨基酸序列与油棕MYB-RADIALIS(RAD)氨基酸序列相似度最高.理化性质、亲/疏水性和无序化分析显示,CnRADIALIS-like转录因子是亲水性蛋白且偏碱性,存在无序化区域.信号肽和跨膜结构域分析表明,其不存在信号肽和跨膜结构域.空间结构分析显示,CnRADIALIS-like有典型的α-螺旋结构.实时荧光定量PCR(qRT-PCR)显示,CnRADIALIS-like基因在4个品种椰子外果皮中的表达量存在显著差异,在红矮椰子中表达量最高,红矮椰子不同组织中在外果皮表达量最高.该基因的表达在红矮椰果从幼果至成熟果的3个发育阶段依次降低,套袋条件下表达量低于正常光照条件下,表明该基因可能与光形态下细胞发育及代谢产物合成存在相关作用.通过对该基因的生物信息功能进行分析,为深入研究其功能及作用机制提供参考,同时以期为深入剖析椰子的外果皮颜色形成机制提供重要的理论依据.

关键词：椰子;外果皮颜色;MYB家族;RAD蛋白

所属期刊栏目：42

分类号：S667.4(果树园艺)

资助基金：国家自然科学基金项目;中国热带农业科学院基本科研业务费项目

在线出版日期：2021-12-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：2478-2486