基于基因组和转录组数据的胡椒内参基因鉴定

摘要：

为系统筛选适合胡椒基因表达模式分析的内参基因,本研究基于胡椒全基因组和转录组数据,初步筛选出62个候选基因.以胡椒主根、芽尖、叶片、花穗、不同发育时期果实以及接种辣椒疫霉菌的主蔓为材料,利用geNorm、NormFinder和BestKeeper软件系统分析候选基因在不同组织中的表达稳定性,结合目标基因的表达模式验证,鉴定稳定表达最优的内参基因为Myeloid leukemia factor 1 (Pn 17.1212).结果 表明:该基因是分析胡椒果实发育、辣椒疫霉菌响应相关基因表达模式的理想内参.内参基因的选择不应仅限于持家基因,全基因组和转录组信息可提供更加全面的参考基因数据,内参基因的准确鉴定需综合转录组信息、基因表达稳定性、标记基因的表达模式验证等数据分析的结果,获得的理想内参基因可满足不同研究对表达稳定性的要求.

关键词：胡椒、内参基因、表达稳定性

所属期刊栏目：41

分类号：S813.3(普通畜牧学)

资助基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项;海南省自然科学基金创新研究团队项目

在线出版日期：2020-12-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：2120-2129