基于SLAF-seq技术的甘薯种质资源群体遗传进化分析

摘要：

基于简化基因组测序技术对122份甘薯种质资源进行分析,开发SNP位点并将其应用于种质资源群体结构和遗传进化分析.结果表明,从122份甘薯种质资源中共获得563.18 Mb读长,不同材料的读长数量在1419809～8392785范围之间.测序质量值Q30在90.61％～96.82％之间,平均Q30为92.78％.测序获得的GC含量在36.46％～40.33％之间,平均GC含量为38.17％,对照GC含量为40.72％.根据测序结果共开发出高质量的SLAF标签2388759个,平均测序深度为17.45×.其中,多态性的SLAF标签77761个,占SLAF标签总数的3.26％.根据所获得多态性SLAF标签统计SNP位点信息,共计获得129063个群体SNP位点.遗传进化分析表明122份种质资源可以分为3个大类,分类结果与它们的地理来源无直接关系,聚类结果可为甘薯育种亲本组配和杂种优势利用提供科学依据.

关键词：甘薯、种质资源、SLAF-seq、遗传进化分析

所属期刊栏目：40

分类号：S531(薯类作物)

资助基金：广西农业科学院基本科研业务专项桂农科2017YM12;国家现代农业产业技术体系广西创新团队建设专项nycytxgxcxtd-11-03;现代农业产业技术体系建设专项CARS-10-C19

在线出版日期：2020-01-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：2390-2396