芒果果实bHLH家族转录因子的生物信息学分析

摘要：

bHLH家族作为植物中较大的转录因子家族之一,在真核生物生长发育调控中具有重要作用.本研究基于芒果果实转录组数据,利用生物信息学方法鉴定出87个bHLH家族蛋白,其中酸性蛋白所占比例较大,大部分为不稳定蛋白,且均为不含信号肽的亲水性蛋白,除CL10714.Contig1为膜结合转录因子外,其余均不含跨膜结构.芒果bHLH蛋白结构域有多个氨基酸位点保守性较高,87个芒果bHLH蛋白中73个(83.91％)具有E-box结合功能.GO分析发现芒果bHLH蛋白共注释到生物学过程、细胞组分和分子功能3大类功能的17个亚类.进化树分析发现芒果bHLH蛋白与拟南芥有较高的保守性,并基于进化树对部分bHLH蛋白的功能进行了预测.本研究结果将为下一步芒果bHLH蛋白的功能研究奠定基础.

关键词：芒果、bHLH家族、转录因子、生物信息学

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分类号：S667.7(果树园艺)

资助基金：广东省自然科学基金-粤东西北创新人才专项2016A030307006;国家重点研发计划项目2017YFD0202107;热带果树种质资源收集、鉴定、编目、繁殖更新与保存分发利用专项

在线出版日期：2019-05-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：289-299