木薯sRNA测序分析及其开花相关microRNA的挖掘

摘要：

为研究木薯花序与叶片中sRNA表达特性,探索microRNA对其开花过程的调控.本研究以木薯品种"华南八号"花序和幼叶为材料,利用RNA-seq技术进行sRNA测序分析;并筛选开花相关microRNAs进行表达特性分析.从花序和幼叶测序结果中分别获得12092109条和11499655条sRNA序列.花序中筛选出139条已知microRNAs和253条新预测microRNA,分别预测得到992和3736条靶基因;幼叶中筛选出134条已知microRNA和191条新预测microRNAs,分别预测得到979和2603条靶基因.最终筛选出8种与开花调控相关和3种花色调控相关的microRNAs.表达分析显示,miRNAs在两样品间呈现出较大的整体性差异,并且在功能与代谢通路上也不尽相同;开花相关microRNAs中表达差异较大的为miR156、miR172和miR169,其中miR156表达量在花序中高于幼叶,而miR172表达量在花序中低于幼叶,推测其功能为抑制后续的开花过程,避免过度开花.本研究分析了木薯花序与幼叶中sRNA的整体特性,通过表达差异分析初步明确了microRNAs对木薯开花的调控,为进一步深入探索奠定了基础.

关键词：木薯、sRNA、microRNA、开花、表达特性

所属期刊栏目：39

分类号：S533(薯类作物)

资助基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目1630032014036,1630032018009

在线出版日期：2019-02-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：2427-2435