基于EST和GSS序列的茶树miRNA及其靶基因数据挖掘

摘要：

microRNA(miRNA)是一类长19～24个碱基的小分子内源性非编码单链RNA,通过介导靶基因的裂解或抑制靶基因的翻译,在植物的发育、新陈代谢、应激响应等方面起着重要的调控作用,在进化上具有高度的保守性.据此本研究以miRBase注册的全部成熟植物miRNA序列为探针,基于NCBI数据库中茶树表达序列标签(EST)和基因组勘测序列(GSS)进行同源搜索和miRNA二级结构分析,总共发现7条茶树的miRNA,分属于6个不同的miRNA家族.通过靶基因的预测分析表明,这些miRNA可能调节28种靶标基因,功能涉及新陈代谢、生长发育、胁迫应答及转录,为茶树miRNA的试验鉴定和功能研究提供更详细精确的范围,为进一步探究茶树miRNA的调控机理奠定基础.

关键词：microRNA、茶树、EST、GSS、靶基因

所属期刊栏目：39

分类号：S571.1

资助基金：福建省教育厅中青年教师教育科研项目JAT170178;国家自然科学基金31370688;福建农林大学安溪茶学院青年基金项目ACKY2017004;福建农林大学科技创新专项基金CXZX2017255;江苏省科技计划项目BE2016417

在线出版日期：2019-01-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1999-2006