兰科植物FNR基因的密码子偏好性分析

摘要：

为揭示兰科植物FNR基因的特性和密码子偏好性,采用DNAMAN、CodonW和SPSS软件及EMBOSS、SWISS-MODEL在线网站对17种兰科植物的FNR基因序列、氨基酸序列、同源区域及蛋白质三维结构进行分析.结果表明:兰科植物FNR基因普遍具有在A/T(U)与G/C之间较弱的密码子偏好性;密码子的末位在A和T(U)之间存在显著的T(U)偏好性,在C和G之间存在显著的C偏好性;NADP结合域比非结合域有较小的密码子偏好性;基于CDS和氨基酸聚类结果比基于RSCU聚类更接近于植物的进化分类;自然选择的作用是导致兰科植物FNR基因的密码子使用偏好性的主要成因.

关键词：兰科、FNR基因、密码子偏好性

所属期刊栏目：39

分类号：S682.31(观赏园艺（花卉和观赏树木）)

资助基金：福建省重大科技专项2015NZ0002-1;闽江学者奖励计划项目MJJZ13-003

在线出版日期：2018-11-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1137-1145