10.3969/j.issn.1000-2561.2016.03.017
香蕉MaTPS4基因序列及表达特性分析
通过随机克隆测序法从香蕉根系cDNA文库中获得海藻糖合成酶基因,命名为MaTPS4,全长cDNA序列为2930bp,含一个完整的开放阅读框2574bp,编码857个氨基酸.生物学信息分析表明,MaTPS4蛋白属于不稳定、疏水性蛋白,p15.59,结构域TPS和TPP.序列预测分析表明,MaTPS4蛋白定位于细胞质中,具有3个跨膜区域,不存在信号肽.与其他已知植物TPS氨基酸序列同源比对,同源性达到84.90%;进化关系分析表明,香蕉MaTPS4氨基酸与银杏TPS氨基酸序列(AAX16014.1)聚为一类,二者亲缘关系较近,同源性为99%.器官特异性分析表明,MaTPS4在香蕉根系、球茎、假茎、叶、花、果实各器官中均有表达,其中球茎、假茎、叶片和花中表达量较大,根及果实中表达量极少.qRT-PCR分析表明,MaTPS4在根系中的表达经干旱、盐胁迫后均增强,其中盐胁迫24h时MaTPS4表达量较0h时高5倍;冷胁迫下,MaTPS4表达量增加,并随时间延长下降,在6h达到最大;ABA胁迫下,MaTPS4表达量增加,为0h的5倍;在ACC和FocTR4胁迫下,MaTPS4表达无变化.因此,MaTPS4可能通过依赖ABA途径调控抗逆胁迫相关基因表达,提高植株对非生物胁迫的抗逆性.
香蕉、海藻糖-6-磷酸合成酶基因(TPS4)、生物信息学、表达分析
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S668.1(果树园艺)
农业部重点实验室开放式课题RRI-KLOF1403;“十二五”农村领域国家科技计划2011AA10020605;现代农业产业技术体系建设专项CARS-32;海南省耕地改良关键技术研究与示范专项HNGDpz2015
2016-08-04(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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