橡胶树磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因HbPPC1的克隆和表达分析

摘要：

根据橡胶树磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)基因的部分序列设计引物,运用RT-PCR和RACE方法获得其家族成员的1个全长cDNA,命名为HbPPC1,长度3 025 bp,包含5'-UTR 34 bp,3'-UTR 93 bp,开放阅读框2 898bp,编码965个氨基酸.预测HbPPC1分子量为110.34 ku,理论等电点为6.09.HbPPC1具有C3型PEPC的结构特征,其N端第9～17位残基是可逆磷酸化的不变序列-X-X-SIDAQLR,C端倒数第4位残基为谷氨酰胺(Q),第774位残基为丙氨酸(A).HbPPC1与5条大戟科植物的PEPC序列(其中木薯2条、蓖麻2条、麻风树1条)的同源性达到95％.系统进化分析表明,HbPPC1与这5条序列聚在同一个进化支中.HbPPC1包含2个酶活性位点和7种类型的Motifs,二级结构以由α-螺旋和无规则卷曲为主.Real-time RT-PCR结果表明,HbPPC1在橡胶树胶乳、叶片、树皮和花中均表达,在胶乳中的表达量最高;胶乳HbPPC1的表达受乙烯利刺激影响,在乙烯利刺激4～72 h后胶乳HbPPC1表达明显下调,表明HbPPC1在胶乳pH值调控中起重要作用.本研究结果为HbPPC1的功能研究提供理论依据.

关键词：橡胶树、磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶、cDNA、生物信息学分析、表达模式

所属期刊栏目：36

分类号：S794.1(森林树种)

资助基金：中国热带农业科学院橡胶研究所基本科研业务费1630022012011

在线出版日期：2015-07-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：895-900