文心兰OnCOBRA基因克隆及表达模式分析

摘要：

以文心兰试管苗为材料,采用RT-PCR结合RACE法,克隆文心兰OnCOBRA基因的cDNA全长和DNA序列.结果表明:COBRA全长为1 601 bp,开放阅读框(ORF)为1 386 bp,共编码461个氨基酸;OnCOBRA的DNA序列共2 949 bp,且含有6个外显子和5个内含子.生物信息学结果表明,OnCOBRA属于不稳定的疏水蛋白,具有信号肽、跨膜结构和CCVS保守区域,亚细胞定位于细胞膜中;与无油樟、玉米、籼稻、拟南芥等具有较高的同源性.系统进化树分析结果表明,文心兰OnCOBRA蛋白与玉米(ZmCOBRA)、无油樟(AtCOBRA)、籼稻(OsCOBRA)处于统一分枝,推测OnCOBRA基因是COBRA基因家族的成员.qPCR结果表明,OnCORBA为组成型表达,在成苗期表达量最高,在文心兰类原球茎时期表达量最低.

关键词：文心兰、COBRA、克隆、生物信息学、qPCR

所属期刊栏目：35

分类号：S682.31(观赏园艺（花卉和观赏树木）)

资助基金：福建省农业科技平台2008N2001;国家科技支撑计划2007BAD07B03

在线出版日期：2014-10-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1551-1558