芒果细菌性黑斑病菌XcmR基因的克隆与序列分析

摘要：

根据黄单孢菌属LuxR基因的同源性设计简并引物XF/XR,采用同源克隆法从芒果细菌性黑斑病菌(Xanthomonas campestris pv.mangiferaeindicae)中获得了约1.4kb的DNA片段.经测序和序列同源性分析表明,该基因片段长1 422 bp含有一个完整的LuxR同源基因,并命名为XcmR.生物信息学分析表明,XcmR基因完整0RF(开放阅读框)全长765 bp,编码254个氨基酸,分子质量和等电点分别约为28.2 ku和8.9,与GenBank中公布的Xanthomonas属LuxR或AhvR/AsaR氨基酸序列具有86％～99％相似性.系统聚类结果表明,XcmR与来源于柑桔溃疡病菌(X.axonopodis pv.citri)、番茄疮痂病菌(X.c.pv.vesicatoria)、水稻白叶枯菌(X.oryzae pv.oryzae)和甘蓝黑腐病菌(X.c.pv.campestris)的LuxR蛋白聚成一支.NCBI网站蛋白质保守结构域搜索表明,XcmR是LuxR蛋白家族的一员,具有LuxR蛋白相似结构.

关键词：芒果细菌性黑斑病菌、群体感应、XcmR、生物信息学

所属期刊栏目：32

分类号：S436.67(病虫害及其防治)

资助基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项项目No.2009hzs1J006；公益性行业农业科研专项200903034

在线出版日期：2011-12-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：663-667