10.3969/j.issn.1000-2561.2010.11.015
巴西橡胶树棒孢霉落叶病菌Slt2类MAPK同源基因CMP1的克隆与序列分析
根据几种丝状真菌Slt2类MAPK的保守氨基酸序列设计简并引物,从巴两橡胶树棒孢霉落叶病菌[Corynespora cassiicola(Berk.& Curt.)Wei]中扩增出MAPK同源基因的部分片段,再利用染色体步移法延伸该片段的上、下游邻接序列,获得MAPK编码基因的全长序列,命名为CMP1(GenBank Accession No.GU321364).序列分析表明,该基因含有5个外显子和4个内含子,编码417个氨基酸的多肽,推测分子量为47.5 ku,等电点为5.57.CMP1含有一个参与双重磷酸化作用的MAPK蛋白激活域(TEY),其氨基酸序列与丝状真菌的MAPK,AAslt2和MAP-kinase等高度同源.系统聚类结果显示,该基因与白菜黑斑病菌(Alternaria brassicicola)、细交链格孢菌(A.alternata)和玉米小斑病菌(Cochliobolus heterostrophus)的Sh2类MAPK基因具有较高的同源性.Southern杂交分析表明,CMP1基因在巴西橡胶树棒孢霉落叶病菌基因组中以单拷贝形式存在.
橡胶树棒孢霉落叶病菌、蛋白激酶、基因克隆、生物信息学
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S432(病虫害及其防治)
农业部公益性橡胶树行业科研专项nyhyzx07-033
2011-04-15(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共8页
1951-1958